Henri-Jean Schubnel a été le commissaire de 32 expositions au Muséum National d’Histoire Naturelle (il peut y avoir un second commissaire).
Principales expositions avec édition de catalogue :
- Salon des minéraux (1975)
- Pierres précieuses du monde entier (catalogue de la Fondation de France, 1976)
- Cristaux géants 772 000 entrées et 29 700 catalogues vendus (avec Alfred Berthelot, 1983)
- Cristaux Géants II (1987)
- La Pierre et l’homme (avec Teresa Battesti, 1987)
- Trois siècles de Minéralogie (1988)
- Métal, homme et dieux (1989)
- Cristaux Précieux (avec Claude Guillemin, 1990)
- Trésor du Muséum (1991)
- L’âge du Silicium (avec François Fröhlich, 1991)
- Jades impériaux (avec Teresa Battesti et Eric Gonthier, 1993)
- Trésor des Philippines (avec Teresa Battesti et Eric Gonthier, 1994)
- Vision de Volcans (avec Monique Ducreux et Eric Gonthier, 1995)
- Minéraux de France (avec Pierre Jacques Chiappero, 1995)
• L’imaginaire des Pierres précieuses (1996)
- Histoire naturelle de la radioactivité, célébration nationale du centenaire de la découverte au Muséum de la radioactivité par Henri Becquerel en 1896 et de la découverte du radium par Pierre et Marie Curie en 1898 (avec P.J. Chiappero et E. Gonthier, 1996)
- Les âges de la terre (avec François Fröhlich, 1999)
- Le Lutétien, la pierre de Paris (avec François Fröhlich, 2000)
- Trésor du Muséum, 10 ans d’accroissement du patrimoine, Mécénat de TOTAL (avec Pierre Jacques Chiappero, 2001)